百鸽

「花札卫-五光-」の『②：自分の「花札卫」モンスターが相手モンスターと戦闘を行う場合、バトルフェイズの間だけその相手モンスターの効果は無効化される』モンスター効果が適用される場合、自分の「花札卫」と名のついたモンスターと戦闘を行う相手モンスターは、バトルフェイズの間だけフィールドにて発動・適用されるモンスター効果が無効化されます。

したがって、質問の状況のように、戦闘で破壊され墓地へ送られた際に発動する「水晶机巧-柠晶龙」のモンスター効果は無効化されず、『デッキから「水晶机巧」モンスター１体を守備表示で特殊召喚する』処理は通常通り適用されます。