百鸽

「精灵兽 心企太」の効果処理時に、『エクストラデッキから「灵兽」モンスター１体を除外し』の処理と、『そのモンスターと同じ種族の「灵兽」モンスター１体をデッキから墓地へ送る』の処理の両方を行う事ができない状態となっている場合、「精灵兽 心企太」の効果処理は適用されません。

したがって、質問の状況のように、デッキに「灵兽」と名のついたモンスターが存在しなくなっている場合には、エクストラデッキから「灵兽」と名のついたモンスターを除外する処理も行いません。