百鸽

「恶魔巨神」の『①：モンスターゾーンのこのカードが効果で破壊される場合、代わりに５００LPを払う事ができる。この効果はこのカードがフィールドに表側表示で存在する限り１度しか使用できない』効果は、「恶魔巨神」がモンスターゾーンに表側表示で存在する際に適用される永続効果です。

質問の状況の場合、「雷破」によって破壊される際に、「恶魔巨神」は裏側守備表示となっていますので、『モンスターゾーンのこのカードが効果で破壊される場合、代わりに５００LPを払う』処理を適用する事はできません。